Pour les vaccinations internationales, l'Institut Pasteur du Maroc est le seul centre du Royaume agrée par l’O.M.S pour le vaccin contre la fièvre jaune.

Il assure aussi les prestations vaccinales individuelles ou de masse grâce aux campagnes de vaccinations, périodiques contre la grippe et tout au long de l'année contre l'hépatite virale B, le Tétanos, méningites ….